PENAPISAN MOLEKULAR KANDIDAT OBAT SINTETIK TUBERKULOSIS TERHADAP PROTEIN TIROSIN KINASE Mycobacterium tuberculosis

  • Harry Noviardi Sekolah Tinggi Teknologi Industri Dan Farmasi Bogor
  • Eem Masaenah Sekolah Tinggi Teknologi Industri dan Farmasi Bogor
  • Rizky Ramadhan Sekolah Tinggi Teknologi Industri dan Farmasi Bogor
Keywords: Inhibitor, Protein Tirosin Kinase, Senyawa turunan sintetik, Tuberkulosis

Abstract

Mycobacterium tuberculosis (Mtb) merupakan bakteri penyebab infeksi pada penyakit Tuberkulosis (TB). Sebagian besar obat TB yang dikembangkan pada saat ini mulai dilakukan sejak 40 tahun lalu.

Obat tersebut memungkinkan terjadinya resistensi terhadap Mycobacterium tuberculosis. Oleh karena itu perlu dikembangkan obat baru yang dapat mengobati TB. Protein tirosin kinase dapat dijadikan target pengobatan TB karena memainkan peran kunci dalam fisiologi Mycobacterium tuberculosis  dan patogenesis. Pada penelitian ini dilakukan analisis efektifitas dari senyawa-senyawa turunan sintetik sebagai inhibitor pada penambatan molekular terhadap protein tirosin kinase yang berperan penting pada penyakit tuberculosis. Senyawa turunan sintetik dilakukan analisis penambatan molecular. Penentuan nilai konstanta inhibisi serta visualisasi interaksi obat dilakukan menggunakan Pymol dan Discovery Visualizer. Aktivitas farmakologi atau biologi senyawa ligan ditentukan berdasarkan kriteria Lipinski’s Rule of Five. Analisis toksisitas dengan menggunakan Toxtree dan admetSAR. Berdasarkan pada hasil penelitian diperoleh 5 kandidat senyawa potensial sebagai tuberkulosis, yaitu DC-159a, Delamid, BTZ-043, TBA-7371, dan PBTZ169 dengan nilai binding affinity berturut-turut -9,7; -9,6; -9,5; -9,4; dan -9,1 kkal/mol.Hasil analisis Lipinski menunjukkan bahwa semua senyawa tersebut memenuhi kriteria Lipinski. Sedangkan hasil uji toksisitas menunjukkan bahwa semua senyawa tersebut tidak berpotensi bersifat karsinogenik dan mutagenik

References

[1] [WHO] World Health Organization. Global Tuberculosis Report 2017. 2017. WHO. Geneva. 15-49.
[2] Tripathi, R.P., Tewari, N., Dwivedi, N., Tiwari, V. K., 2005, Fighting Tuberculosis: an Old.Disease with New Challenges, Medical Research Reviews, 25, 93-131.
[3] Villemagne B, Crauste C, Flipo M, Baulard AR, Déprez B, 2012, Tuberculosis: the drug development pipeline at a glance. European Journal of Medicinal Chemistry. 51: 1-16.
[4] Quan, D., Nagalingam, G., Payne, R., Triccas, J. A. 2017. New tuberculosis drug leads from naturally occurring compounds. International journal of infectious diseases : IJID : official publication of the International Society for Infectious Diseases, 56, 212–220.
[5] Wong, D., Li, W., Chao, J. D., Zhou, P., Narula, G., Tsui, C., Ko, M., Xie, J., Martinez-Frailes, C., Av-Gay, Y. 2018. Protein tyrosine kinase, PtkA, is required for Mycobacterium tuberculosis growth in macrophages. Scientific reports. 8(1), 155.
[6] Mubarok, M.F., Dewi, A., Ainun, W., Jenie., Septiseptyani, E.P., Edy, M. 2008. Peningkatan Aktivitas Sitotoksik Doxorubisin Terhadap Sel Kanker Payudara MCF-7 Menggunakan Ekstrak Etanolik Daun Awar-Awar (Ficus septia Burm.F). Yogyakarta: Fakultas Farmasi Universitas Gadjah Mada. Prosiding Kongres Ilmiah ISFI. XVI: 1-8.
[7] Lipinski, C.A. 2004. Lead- and drug-like compounds: the rule-of-five revolution. Drug Discov. Today Technol. 1, 337-341.
[8] Cole, J. C., J. W. Nissink & O. Taylor. 2005. Protein-Ligand Docking and Virtual Screening with GOLD. In J. Alvarez & B. Shoichet. Virtual Screening in Drug Discovery. Boca Raton: CRC Press.
[9] Drie, J. H. 2005. Pharmacophore-Based Virtual Screening: A Partical Prespective. In J. Alvarez & B. Shoichet. Virtual Screening in Drug Discovery. Boca Raton: CRC Press.
[10] Yannuar, Arry. 2012.Penambatan Molekular Praktek dan Aplikasi pada Virtual Screening. Depok: Fakultas Farmasi Universitas Indonesia.
[11] Saputri, K.E., Nurul, F., Erwinda, K., Dedy P., Broto, S. 2016. Docking Moleculer potensi antidiabetes Melitus Tipe 2 Turunan Zerumbon sebagai Inhibitor Aldosa Reduktase dengan Autodock Vina. Chimica et Natura 4(1): 16-20.
Published
2020-12-02
How to Cite
Harry Noviardi, Masaenah, E., & Ramadhan, R. (2020). PENAPISAN MOLEKULAR KANDIDAT OBAT SINTETIK TUBERKULOSIS TERHADAP PROTEIN TIROSIN KINASE Mycobacterium tuberculosis. Jurnal Farmamedika (Pharmamedika Journal), 5(2), 60-69. https://doi.org/10.47219/ath.v5i2.104