AKTIVITAS ANTIOKSIDAN DAN STUDI IN SILICO EKSTRAK BUAH PALA (Myristica fragrans Houtt)

  • Bina Lohita Sari Universitas Pakuan
  • Nyanyu Siti Aminah Lily Elfrieda Universitas Pakuan
  • Kasman Marsuan Universitas Pakuan
  • Puput Sapitri Sekolah Tinggi Ilmu Kesehatan Harapan Ibu Jambi
  • Abdurrahman Hafidh Universitas Pakuan
Keywords: AutoDok Tools, DPPH, studi in vitro, in silico

Abstract

Antioksidan adalah senyawa yang dapat mencegah atau memperlambat kerusakan sel, sehingga melindungi sistem biologis di dalam tubuh. Salah satu enzim yang dapat melindungi sel-sel dalam tubuh akibat serangan radikal bebas adalah superoxide dismutase (SOD).  Senyawa aktif berupa metabolit sekunder dari bahan alam, umumnya mempunyai aktivitas antioksidan. Berdasarkan studi in vitro dan in silico, maka penelitian ini menentukan aktivitas antioksidan ekstrak etanol buah Pala (Myristica fragrans Houtt) dan mendapatkan senyawa aktifnya berupa senyawa induk dan analognya. Senyawa analog dari bahan alam mempunyai bioavailabilitas yang lebih baik. Metode maserasi dengan pelarut etanol dilakukan untuk mendapatkan ekstrak kental, kemudian dikeringkan dengan vacuum dryer. Penentuan aktivitas antioksidan menggunakan pereaksi 2,2 difenil-1-pikrilhidrazil) atau DPPH. Pengumpulan senyawa aktif pada buah Pala menggunakan basis data KnapSack dan metode penambatan molekuler menggunakan AutoDock Tools dengan target enzim SOD dari PDBID:4A7G. Hasil aktivitas antioksidan ekstrak etanol buah Pala sebesar 100,52 ± 1,06 ppm. Hasil penambatan molekuler dengan nilai penambatan yang lebih negatif dari senyawa lainnya, adalah senyawa induk myristicin dan analog isoeugenol yaitu methyl isoeugenol dengan nilai ∆G sebesar -3,28 ± 0,028 dan -3,23±0,01. Kedua senyawa berikatan dengan residu His110 yang berperan sebagai asam amino aktif inhibitor antioksidan.

References

Perez, C., and Ortiz, A.R. 2001. Evaluation of Docking Functions for Protein-Ligand Docking. J Med Chem. 44(23): 68-85.
Choi, K.Y., Swierczewska, M., Lee, S., dan Chen, X. (2012): Review Protease-Activated drug development, Theranosttiics, 2(2): 156-178.
Lipinski, C.A., Lombardo, F., Dominy, B.W., and Feeney, P.J. 2001. Experimental and Computational Approaches To Estimate Solubility and Permeability in Drug Discovery and Development Setting. Advanced Drug Delivery Review. 46(1-3) : 3-26.
Kementrian Kesehatan Republik Indonesia. 2013. Farmakope Herbal Indonesia. Edisi 1 , Jakarta: Kementrian Kesehatan Republik Indonesia.
Departemen Kesehatan. 2000. Parameter Standar Umum Ekstrak Tumbuhan Obat. Cetakan I. Jakarta: Direktorat Jendral Pengawasan Obat dan Makanan, Direktorat pengawasan Obat dan Makanan, Direktorat Pengawan Obat Tradisional.
Hanani. E, 2014, Analisis Fitokimia, EGC, Penerbit Buku Kedokteran.
Molyneux, P. 2004. The Use of Stable Free Radikal Diphenylpicryl-hydrazyl (DPPH) For Estimating Antioxidant Activity, Songklanakarin J, Sel Technol.
Rawling, N.D., Barrett, A.J., Thomas, P.D., Huang, X., Bateman, A., and Finn, R.D. 2018. The MEROPS database of proteolytic enzymes their substrates and inhibitors in 2017 an d a comparison with peptidases in the PANTHER database. Nucleic Acids Research. 46:624-632.
Rachmania, R.A., Supandi., dan Larasati, O.A. 2015. Analisis in-silico senyawa diterpenoid lakton herba sambiloto (Andrographis paniculate Nees) pada reseptor alpha-glucosidase sebagai antidiabetes tipe II. Pharmacy. 12 (2): 210-222.
Hanachi, R., Belaidi, S., Kerassa, A., and Boughdiri, S. 2015. Structure Activity/Property Relationships of pyrazole Derivatives by MPO and QSAR Methods for Drug Design. Resarch Journal of Pharmaceutical, Biological and Chemical Science. 6 (4): 923-935.
Wu, Y., Zhang, D., Jiang, X., and Jiang, W. 2014. Fruit and vegetable consumption and risk of type 2 diabetes mellitus : a dose-response meta-analysis of prospective cohort studies. Meta-Analysis. 25(2): 140-147
Xiao, W., Wang, D., Shen, Z., Li, S., and Ling, H. 2018. Multi-Body Interactions in Molecular Docking Program Devised with Key Water Molecules in Protein
Dias, R., and Azevedo, W.F. 2008. Molecular Docking Algorithms. Current Drug Targets. 9(12):1040-1047.Binding Sites. Molecules. 23 (9): 1-22.
Desiraju. G. R., T. Steiner. 1999. The Weak Hydrogen Bond In Structural Chemistry And Biologycal. India : University of Hyderabad Pass.
Siswandono, Bambang Soekarjdjo. 2000. Kimia Medisinal. Surabaya : Airlangga University Press.
Syahputra, G., Ambarsari, L., dan Sumaryada, T. 2014. Simulasi Docking Kurkumin Enol, Bisdemetoksikurkumin dan Analognya Sebagai Inhibitor Enzim12-Lipoksigenase. Jurnal Biofisika. 10(1): 55-67.
Simamora, R.E.M. 2015. Penambatan Molekul Senyawa Katekin serta Turunannya Pada Teh Hijau Terhadap Protein Fat Mass Obesity (FMO). Skripsi. Fakultas Matematika dan Ilmu Pengetahuan Alam Institut Pertanian Bogor.
Winarsi, Hery. 2007. Antioksidan Alami dan Radikal Bebas. Yogyakarta : Kanisius.
Published
2022-06-14
How to Cite
Lohita Sari, B., Aminah Lily Elfrieda, N. S., Marsuan, K., Sapitri, P., & Hafidh, A. (2022). AKTIVITAS ANTIOKSIDAN DAN STUDI IN SILICO EKSTRAK BUAH PALA (Myristica fragrans Houtt). Jurnal Farmamedika (Pharmamedika Journal), 7(1), 28-40. https://doi.org/10.47219/ath.v7i1.142