PENAPISAN VIRTUAL SENYAWA PROPOLIS LEBAH Tetragonula sp. SEBAGAI KANDIDAT HEPATOPROTEKTOR MELALUI PENDEKATAN MOLEKULAR DOCKING TERHADAP ENZIM ALANINE AMINOTRANSFERASE DAN ASPARTATE AMINOTRANSFERASE

Authors

  • Adimas Dwi Tyassandi Universitas Muhammadiyah Kalimantan Timur
  • Paula Mariana Kustiawan Universitas Muhammadiyah Kalimantan Timur
  • Putri Hawa Syaifie Nano Center Indonesia

DOI:

https://doi.org/10.47219/ath.v11i1.585

Keywords:

ALT, AST, Hepatoprotektor, Propolis, Penambatan Molekuler

Abstract

Hati merupakan organ utama yang berperan dalam menjaga homeostasis tubuh, khususnya dalam proses detoksifikasi dan metabolisme. Kerusakan hati yang dipicu oleh paparan xenobiotik dan stres oksidatif umumnya ditandai dengan peningkatan kadar enzim alanine aminotransferase (ALT) dan aspartate aminotransferase (AST). Penelitian ini bertujuan untuk mengevaluasi potensi hepatoprotektif senyawa bioaktif dari propolis lebah kelulut (Tetragonula sp.) melalui pendekatan penapisan virtual berbasis molecular docking. Sebanyak delapan senyawa dipilih berdasarkan studi literatur dan didocking terhadap target protein ALT (PDB ID: 3IHJ) dan AST (PDB ID: 1YAA) menggunakan AutoDock Vina yang terintegrasi dalam PyRx, dengan visualisasi struktur dilakukan menggunakan BIOVIA Discovery Studio. Validasi metode dilakukan melalui redocking dengan nilai root mean square deviation (RMSD) < 2 Å yang menunjukkan keandalan metode docking yang digunakan. Hasil penelitian menunjukkan bahwa Kuwanon T memiliki afinitas pengikatan tertinggi terhadap AST (-7,2 kkal/mol) dan ALT (-5,8 kkal/mol), dibandingkan dengan senyawa pembanding silibinin (-7,0 dan -5,0 kkal/mol). Perbedaan energi ikatan yang relatif kecil (<1 kkal/mol) mencerminkan profil afinitas yang sebanding antar ligan, yang didukung oleh kesesuaian interaksi dengan residu asam amino kunci pada situs pengikatan. Temuan ini menunjukkan bahwa Kuwanon T berpotensi sebagai kandidat awal agen hepatoprotektor. Secara keseluruhan, penelitian ini memberikan dasar komputasional dalam pengembangan senyawa turunan propolis, serta mendukung kajian lanjutan melalui uji in vitro, in vivo, dan analisis farmakokinetik untuk aplikasi terapeutik di masa mendatang.

References

Devarbhavi H, Asrani SK, Arab JP, et al. Global burden of liver disease: 2023 update. J Hepatol 2023; 79: 516–537.

Dewi DC, Metasari D. Gambaran Kadar Serum Glutamic Pyruvic Transaminase (SGPT) Pada Akseptor Pil Kontasepsi Di Puskesmas Pembantu Pagar Dewa I Kecamatan Selebarkota Bengkulu Tahun 2021. J Midwifery 2022; 10: 1–7.

Reza A, Rachmawati B. Perbedaan kadar sgot dan sgpt antara subyek dengan dan tanpa diabetes mellitus. J Kedokt Diponegoro (Diponegoro Med Journal) 2017; 6: 158–166.

McGill MR. The past and present of serum aminotransferases and the future of liver injury biomarkers. EXCLI J 2016; 15: 817.

Senior JR. Alanine aminotransferase: a clinical and regulatory tool for detecting liver injury–past, present, and future. Clin Pharmacol Ther 2012; 92: 332–339.

Awang N, Ali NA, Majid FAA, et al. Total flavonoids and phenolic contents of sticky and hard propolis from 10 species of Indo-Malayan stingless bees. Malaysian J Anal Sci 2018; 22: 877–884.

Yasir A, Adjeng A, Firgianti S, et al. Antioxidant Activity of Stingless Bee Propolis (Tetrigona apicalis) Extracts from Dammar Forest Vegetation. FITOFARMAKA J Ilm Farm 2024; 14: 87–98.

Yanti EN, Kustiawan PM. Study of Indonesian stingless bee propolis potential as antioxidant: a review. J Farm Sains Dan Prakt 2023; 261–269.

Kustiawan PM, Dewi SR, Pratiwi J, et al. Phytochemical Analysis and Anti-Inflammatory Activity of The Combination of Trigona apicalis propolis Extract and Honey. Borneo J Pharm 2023; 6: 125–132.

Mohamed WAS, Ismail NZ, Muhamad M, et al. Q-TOF LC-MS compounds evaluation of propolis extract derived from Malaysian stingless bees, Tetrigona apicalis, and their bioactivities in breast cancer cell, MCF7. Saudi J Biol Sci 2022; 29: 103403.

Fan J, Fu A, Zhang L. Progress in molecular docking. Quant Biol 2019; 7: 83–89.

Komari N, Safarina T, Ahmad MM, et al. Evaluasi Docking Molekular Potensi ?-Sitosterol dari Kelakai (Stenochlaena palustris) sebagai Inhibi-tor Estrogen Receptor. J Pharmascience 2022; 9: 248–257.

Pinzi L, Rastelli G. Molecular docking: shifting paradigms in drug discovery. Int J Mol Sci 2019; 20: 4331.

Upadhyay R, Singh C, Mishra AK, et al. Estimation of antioxidant potential, phytochemical profiling, and in silico characterization of hepatoprotective biomarkers of Phyllanthus fraternus GL Webster leaves. Chem Sel 2023; 8: e202300581.

Jeong SY, Jin H, Chang JH. Crystal structure of L-aspartate aminotransferase from Schizosaccharomyces pombe. PLoS One 2019; 14: e0221975.

Arba M, Nur-Hidayat A, Usman I, et al. Virtual screening of the Indonesian medicinal plant and zinc databases for potential inhibitors of the RNA-dependent RNA polymerase (RdRp) of 2019 novel coronavirus. Indones J Chem; 20.

Biluca FC, de Gois JS, Schulz M, et al. Phenolic compounds, antioxidant capacity and bioaccessibility of minerals of stingless bee honey (Meliponinae). J Food Compos Anal 2017; 63: 89–97.

Ibáñez B, Melero A, Montoro A, et al. Radioprotective effects from propolis: a review. Molecules 2023; 28: 5842.

Amrulloh LSWF, Harmastuti N, Prasetiyo A, et al. Analysis of molecular docking and dynamics simulation of mahogany (Swietenia macrophylla King) compounds against the PLpro enzyme SARS-COV-2. J Farm dan Ilmu Kefarmasian Indones 2023; 10: 347–359.

Akyuni Q, Putri DH, Ahda Y. The Prediction of the Interaction Genistein and Daidzein Compounds on ESR2 Expression by Molecular Docking. J Serambi Biol 2023; 8: 32–37.

Hanif AU, Lukis PA, Fadlan A. Pengaruh Minimisasi Energi MMFF94 dengan MarvinSketch dan Open Babel PyRx pada Penambatan Molekular Turunan Oksindola Tersubstitusi. Alchemy J Chem.

Ramadhan S, Kustiawan PM. Uji Toksisitas Akut Ekstrak Propolis Lebah Kelulut Tetrigona apicalis dan Homotrigona fimbriata terhadap Mencit (Mus musculus L.). J Pharmascience 2024; 12: 143–156.

Ko W, Liu Z, Kim KW, et al. Kuwanon T and sanggenon a isolated from Morus alba exert anti-inflammatory effects by regulating NF-?B and HO-1/Nrf2 signaling pathways in BV2 and RAW264. 7 cells. Molecules 2021; 26: 7642.

Liang HW, Yang TY, Teng CS, et al. Mulberry leaves extract ameliorates alcohol-induced liver damages through reduction of acetaldehyde toxicity and inhibition of apoptosis caused by oxidative stress signals. Int J Med Sci 2021; 18: 53.

Sahlan, M., Hapsari NRA, Pratami KD, et al. Potential hepatoprotective effects of flavonoids contained in propolis from South Sulawesi against chemotherapy agents. Saudi J Biol Sci 2021; 28: 5461–5468.

Downloads

Published

2026-06-04

How to Cite

Tyassandi, A. D. ., Kustiawan, P. M., & Syaifie, P. H. (2026). PENAPISAN VIRTUAL SENYAWA PROPOLIS LEBAH Tetragonula sp. SEBAGAI KANDIDAT HEPATOPROTEKTOR MELALUI PENDEKATAN MOLEKULAR DOCKING TERHADAP ENZIM ALANINE AMINOTRANSFERASE DAN ASPARTATE AMINOTRANSFERASE. Jurnal Farmamedika (Pharmamedica Journal), 11(1), 32–39. https://doi.org/10.47219/ath.v11i1.585